Bir sezon sonra KFC Wintam takımının minikler takımında transfer oldu. Henüz 5 yaşındayken bu Wintam’ın minikler takımında oynadığı futbolla göz doldurdu. İlk büyük transferini ise 6 yaşında yaptı. Belçika 1. Lig takımlarından Lierse, 6 yaşındaki Lukaku’yu minikler takımına transfer etti.
2005’te 12 yaşındayken bu kez de FC Brüksel takımının gözüne çarptı ve Brüksel onu genç takımını transfer etti. Ertesi sezon ise henüz 13 yaşındayken Belçika futbolunun en büyüğü Anderlecht, Lukaku’yu transfer etti.
24 Mayıs 2009’da henüz 15 yaşındayken Standard Liege ile oynanan maçın 69. dakikasında defans oyuncusu Victor Bernardez’in yerine oyuna girdi. Lukaku bu maçtan sadece 11 gün önce ilk profesyonel sözleşmesini imzalamıştı.
İlk golünü ise bir sonraki maçta Zulte Waragem’e attı. Bu maçın yine 69. dakikasında Kanu’nun yerine oyuna giren Lukaku, 89. dakikada profesyonel kariyerinin ilk golünü attı. Anderlecht ile 2012 yılına kadar sözleşmesi var.
Genç takımlar kariyerinde Brüksel formasıyla 68 maçta 68 gol, Anderlecht formasıyla ile 121 maçta 88 gol kaydetti. 15 yaşında gençler liginde gol kralı olurken, 17 maçta 26 gol attı. Bu ligdeki gençlerin yaş ortalaması 16’ydı.