Süper Lig'de 18. haftanın sonuna gelinirken, 18 hafta sonunda topladığı 29 puanla beklentilerin uzağında kalan Fenerbahçe'de işler istenildiği gibi gitmiyor.
Sezon başında büyük umutlarla takımın başına getirilen ancak, beklentilerin çok altında bir performans sergileyen Vitor Pereira'ya "Kendisine bugüne kadar gösterdiği çaba ve çalışmalarından dolayı teşekkür eder, gelecek kariyerinde başarılar dileriz." denilerek veda edilmişti.
Fenerbahçe'yi 2015-2016 sezonunda da çalıştıran ve sezon başında 'Yarım kalan hikayeyi tamamlamak' istiyorum diyerek yeniden sarı-lacivertlilerle sözleşme imzalayan Portekizli menajerin, ikinci dönemi Aralık ayında sona erdi.