Sezon başında bu yıl il kez TFF 1. Lig'de mücadele eden Bandırmaspor'a büyük umutlarla transfer olan Güngör, bordo-beyazlılarda ikinci kaptan konumundaydı.
Güngör, Bandırmaspor'un Antalya kampı öncesi yönetim kurulu kararıyla süresiz olarak kadro dışı bırakıldı. Emre Güngör, daha önce Galatasaray, Antalyaspor ve Eskişehirspor formalarını giymişti.