Goias'tan 2001-02 sezonunda Marsilya'ya transfer olan Fernandao'nun Avrupa macerası 3 yıl sürdü. Toulouse'ta yarım sezon kiralık oynadıktan sonra İnternacional'a giden Brezilyalı, ülkesinde yeniden formuna kavuştu. Fernandao, 2007'de 15 maçta 8 gol attı.